A equipa de gestão do InnovPlantProject tem como finalidade garantir o desenvolvimento harmonioso de toda as ações consignadas no plano anual de atividades, de forma a que os objetivos definidos para o InPP sejam alcançados. A equipa de gestão é responsável pela boa execução do orçamento, por garantir a estruturação do InPP, por coordenar as atividades científicas, nomear os diretores de departamento, articular a colaboração com os parceiros científicos e tecnológicos, promover e gerir projetos de investigação e desenvolvimento, e garantir a criação de inovação e de propriedade intelectual.