O InnovPlantProtect está situado em Elvas, nas instalações da antiga Estação de Melhoramento de Plantas do INIAV. Esta localização é ideal, permitindo a criação de sinergias para melhorar a produtividade da agricultura portuguesa, quer com a própria estação de melhoramento, quer com outras unidades de investigação, desenvolvimento e formação da região, quer com as associações de produtores e o tecido agrícola envolvente.